Prismファイルとリンクさせることができるのは Window版のみです。Mac版ではリンクさせることはできません。
Windowsでリンクさせる方法は下記の通りです。
1.Prismのグラフをコピーし、Prismオブジェクトとして貼り付けます。
メニューバーの編集、右クリックメニューから 形式を選択してはりつけ を選択します。
貼り付けの形式を「GraphPad Prism 5 Project オブジェクト」を選択します。

あるフォルダではファイルを開くことができるが、別のフォルダに移すとファイルを開くことができない場合、下記の原因が考えられます。